Staphylococcus saprophyticus: caractéristiques, taxonomie, morphologie, pathogenèse

Staphylococcus saprophyticus est une bactérie appartenant au groupe des staphylocoques appelé coagulase négative. C'est un microorganisme d'importance clinique, car il provoque des infections urinaires principalement chez les jeunes femmes enceintes ou sexuellement actives.

Alors que d'autres staphylocoques à coagulase négative peuvent causer des infections nosocomiales chez les patients immunodéprimés hospitalisés, Staphylococcus saprophyticus affecte principalement les femmes en bonne santé de la communauté. De plus, c'est la deuxième cause de cystite après Escherichia coli.

Bien qu'il soit généralement présent dans moins de 100 000 unités formant des colonies par millilitre d'urine (UFC / mL), il est systématiquement détecté dans des échantillons en série. C'est pourquoi il est dit que S. saprophyticus est un agent pathogène bien documenté.

L'incidence des infections urinaires dues à S. saprophyticus varie considérablement entre les différentes populations de patients et les différentes zones géographiques. Il est généralement lié à des infections récurrentes et à des calculs rénaux.

Caractéristiques

Staphylococcus saprophyticus est un microorganisme anaérobie facultatif qui habite le tractus gastro-intestinal de l'homme, le rectum étant le site de colonisation le plus fréquent, suivi de l'urètre, de l'urine et du col de l'utérus.

Il habite également le tractus gastro-intestinal des porcs et des poulets. Ceux-ci peuvent être transférés à l'homme à travers leur consommation.

Les personnes colonisées par ce microorganisme ne souffriront pas nécessairement d'infections par cette bactérie.

En revanche, Staphylococcus saprophyticus diffère des autres staphylocoques à coagulase négative en ce qu’il est presque toujours sensible à la plupart des antibiotiques utilisés pour les infections urinaires, à l’exception de l’acide nalidixique et de la fosfomycine.

Cependant, la plupart des souches sont déjà résistantes à la pénicilline et à d’autres bêta-lactamines. Des souches résistantes à l'érythromycine, à la clindamycine, au chloramphénicol et à la lévofloxacine ont été découvertes.

La résistance à ces antibiotiques est principalement due à deux mécanismes: des pompes pour l'expulsion active de l'antibiotique et la modification du site de liaison de l'antibiotique au ribosome bactérien par méthylation.

Parmi les caractéristiques biochimiques qui se détachent dans ce microorganisme, on peut citer:

- manifeste une réaction négative aux tests suivants: coagulase, décarboxylation de l'ornithine, réduction des nitrates en nitrites et fermentation du xylose.

-Quand il donne des résultats positifs aux tests suivants: urée, catalase, fermentation du maltose et saccharose.

-Quelques tests peuvent donner des résultats variables tels que le cas de la fermentation de lactose et de mannitol et la sensibilité à la bacitracine, qui peut être sensible ou résistante.

-Aussi, il est sensible à la polymyxine B et résistant à la novobiocine.

Morphologie

Les staphylocoques à coagulase négative, y compris Staphylococcus saprophyticus, sont morphologiquement similaires à S. aureus et peuvent partager bon nombre de leurs caractéristiques de virulence.

Ce sont des cocci à Gram positif disposés en grappes. Ils ne sont pas mobiles, ils ne forment pas de spores et ils ne sont pas hémolytiques.

Taxonomie

Domaine: Bactéries

Phylum: Firmicutes.

Classe: Cuisine

Ordre: Bacillales.

Famille: Staphylococcaceae.

Genre Staphylococcus.

Espèce: saprophyticus.

Facteurs de virulence

Adhésion

Le principal facteur de virulence de cette bactérie est sa capacité à adhérer spécifiquement en plus grande quantité aux cellules uroépithéliales, urétrale et périurétrale que d’autres staphylocoques.

Le tropisme des cellules indiquées ne correspond pas aux autres types de cellules. Ce tropisme des cellules uroépithéliales peut expliquer en partie la fréquence élevée des infections urinaires produites par ce microorganisme.

Production d'uréase

L'enzyme uréase, en revanche, est un facteur de virulence important pour d'autres agents pathogènes de l'appareil urogénital tels que Proteus sp et Corynebacterium urealyticum, S. saprophyticus n'est pas loin derrière et est également capable de le produire.

L'uréase est un facteur déterminant dans l'invasion du tissu de la vessie chez des modèles animaux d'infection urinaire.

Production de matrice extracellulaire

Il a été démontré que S. saprophyticus doit être en présence d'urine et d'uréase pour une plus grande capacité à produire une matrice extracellulaire, c'est-à-dire à former un biofilm.

Ceci explique les infections récurrentes des voies urinaires et souvent l’échec thérapeutique, car la bactérie lorsqu’elle forme des biofilms est plus résistante à la présence de l’antibiotique.

Protéine fibrillaire

Cette protéine est associée à la surface des bactéries. C'est ce qu'on appelle Ssp (par S. saprophyticus, protéine associée à la surface). On pense que cette protéine participe aux interactions initiales avec les cellules uroépithéliales et, bien entendu, à leur adhésion.

Hémagglutinine

Il est présent à la surface de la bactérie mais son rôle dans la virulence du microorganisme est inconnu.

Hydrophobicité de la surface cellulaire

Certaines souches présentent cette caractéristique et semblent favoriser l’adhérence initiale aux cellules uroépithéliales.

Pathologies et manifestations cliniques

On pense que le passage aux voies urinaires des jeunes femmes se fait par des rapports sexuels, où les bactéries peuvent être transportées du vagin au tissu urinaire.

Les autres facteurs de risque sont: l'utilisation de cathéters urinaires, la grossesse, l'hypertrophie bénigne de la prostate, entre autres.

Les patients atteints d'infections des voies urinaires présentent généralement une dysurie, une pyurie et une hématurie, accompagnées d'une douleur suprapubienne. Chez les patients atteints de pyélonéphrite, une fièvre, des frissons, une tachycardie et des maux de dos peuvent apparaître.

Les infections des voies urinaires supérieures (pyélonéphrite) peuvent survenir chez 41% à 86% des patients et il est parfois possible de voir une bactériémie due à S. saprophyticus comme une complication d'une infection des voies urinaires supérieures.

D'autre part, ce microorganisme a été impliqué dans l'urétrite chez l'homme et la femme (syndrome urétral aigu), d'infections urinaires causées par des sondes.

Il a également été trouvé dans les cas de prostatite, épididymite, bactériémie, septicémie, endocardite et endophtalmie.

De même, il a été isolé des infections urinaires chez les enfants et les adolescents des deux sexes en l'absence d'anomalies structurelles du tractus urinaire.

Des cas de bactériémie et de septicémie ont également été rapportés du fait de l'administration de suppléments nutritionnels contaminés par voie parentérale avec ce microorganisme.

Diagnostic

Cette espèce est résistante à la novobiocine comme S. cohnii, S. lentus, S. sciuri et S. xylosus. Mais ces 4 dernières espèces sont rarement isolées chez les patients.

Pour savoir si la souche est résistante ou sensible, la technique de Kirby et Bauer est montée. Cela consiste à inoculer une plaque de gélose Müeller Hinton uniformément avec un coton-tige imprégné de la suspension bactérienne à 0, 5% de McFarland.

Ensuite, laissez reposer quelques minutes et placez un disque de novobiocine de 5 μg. Il est incubé 24 heures à 37 ° C. Une zone d'inhibition ≤16 mm indique une résistance. Voir l'image en introduction.

Il existe des méthodes semi-automatiques permettant d'identifier le micro-organisme, parmi lesquelles le système API STAPH-IDENT. Ce système est assez bon et a beaucoup de corrélation avec l'identification conventionnelle.

Traitement

Le cotrimoxazole est une excellente option pour traiter la cystite due à ce microorganisme, en raison de ses caractéristiques pharmacocinétiques et pharmacodynamiques, ainsi que de sa tolérance et de sa concentration urinaire élevée.

Une autre option peut être l'acide amoxicilline clavulanique, la nitrofurantoïne et, dans les cas compliqués, le triméthoprime-sulfaméthoxazole.

Dans les infections par cathéter, la vancomycine ou le linézolide est utile.