Enterococcus faecium: caractéristiques, taxonomie, morphologie, pathogenèse

Enterococcus faecium est une bactérie coccoïde à Gram positif faisant partie du microbiote commensal de l'intestin des humains et des animaux. Ils ont également été trouvés dans les sécrétions oropharyngées, vaginales et cutanées.

Faisant partie du microbiote humain, il serait peu pathogène. Cependant, il est actuellement considéré comme un agent pathogène important dans les infections nosocomiales, étant le deuxième genre bactérien le plus fréquemment isolé chez les patients hospitalisés.

Parmi les pathologies dans lesquelles il peut être impliqué figurent des infections graves des voies urinaires, des plaies, une bactériémie et une endocardite. La plupart des infections proviennent du microbiote endogène, bien qu'il puisse être transmis de personne à personne ou par la consommation d'eau ou d'aliments contaminés.

E. faecium est capable de coloniser les voies respiratoires et la peau et de survivre sur la surface d'objets inanimés pendant des périodes prolongées. Ils sont moins fréquents dans les isolats cliniques que E. faecalis .

Bien que E. faecalis représente 80 à 90% des microorganismes trouvés dans les échantillons cliniques, E. faecium n'atteint que 5 à 10% des isolats. E. faecium présente toutefois une plus grande résistance aux antimicrobiens.

Caractéristiques

Ils sont des anaérobies facultatifs, ils fermentent le glucose et d'autres glucides, en obtenant de l'acide lactique comme produit final, mais ils ne produisent pas de gaz.

Il pousse à 37 ° C en 24 heures d'incubation dans des milieux enrichis tels que la gélose au sang, le chocolat et d'autres milieux spéciaux pour l'entérocoque.

Caractéristiques biochimiques

Enterococcus faecium peut se développer dans des bouillons nutritifs contenant 6, 5% de NaCl et hydrolyser l'esculine en présence de 40% de sels biliaires. Il peut supporter un pH allant jusqu'à 9, 6.

Ils produisent de la leucine-aminopeptidase (LAP) et réagissent négativement au test de la catalase.

De même , Enterococcus faecium hydrolyse le L-pyrrolidonyl-β-naphtylamide (PYR) et, selon la classification de Lancefield, appartient au groupe D.

Les caractéristiques susmentionnées sont remplies pour l’ensemble du genre Enterococcus.

Les caractéristiques spécifiques permettant d'identifier les espèces de faecium sont les suivantes: fermentation positive de l'arabinose, tellurite négative, mobilité et pigment négatif.

Susceptibilité aux antibiotiques

Les antimicrobiens recommandés pour Enterococcus faecium sont la vancomycine comme première option.

Cependant, E. faecium a une grande capacité à acquérir des gènes de résistance à ces antibiotiques, de sorte que la majorité des isolats sont résistants à la vancomycine.

S'il s'agit d'un échantillon d'urine, il est recommandé d'essayer la nitrofurantoïne, la tétracycline et la ciprofloxacine. Dans les souches isolées d'infections systémiques telles que la bactériémie, l'endocardite, etc., la gentamicine et la streptomycine en concentration élevée doivent également être testées et la présence de β-lactamase doit être déterminée.

En cas de souches résistantes à la vancomycine, il est recommandé d'essayer le linézolide, la teicoplanine, le chloramphénicol, la tétracycline, l'érythromycine et la rifampicine.

Morphologie

Ce sont des noix de coco à Gram positif qui sont disposées par paires ou par de courtes chaînes. Il ne forme pas de spores et ils ne présentent pas de flagelles, ils ne sont donc pas mobiles.

Dans le sang d'agar, les colonies d' Enterococcus faecium sont d'un blanc crème grisâtre et présentent généralement une hémolyse gamma. À Agar Bilis Esculina, les colonies noircissent l’environnement autour de la colonie.

A Agar Slanetz-Bartley (avec 1% de TTC), les colonies sont brun-rouge et dans Agar KF (avec 1% de TTC), les colonies sont de couleur rose, entourées d'une zone de couleur jaune.

Taxonomie

Domaine: Bactéries

Phylum: Firmicutes.

Classe: Bacilli.

Ordre: Lactobacillales.

Famille: Enterococcaceae.

Genre: Enterococcus.

Espèce: faecium.

Facteurs de virulence

Les facteurs de virulence les plus importants de ce microorganisme sont:

-Hémolysines, avec une action cytolytique sur certaines cellules permettant l’invasion dans le sang.

-La protéine de surface et l'adhésine liant le collagène favorisent la colonisation et donc l'infection.

- De même, il présente d’autres facteurs de virulence tels que la gélatinase, une substance d’agrégation, une lipase, des hémagglutinines et sa grande capacité à acquérir des gènes de résistance aux antibiotiques.

Pathologies

La plupart des infections résultent de l'invasion du microbiote de l'individu, c'est-à-dire qu'elles produisent des infections endogènes.

Il est observé principalement dans les infections des voies urinaires, les infections des voies biliaires, l’endocardite et la septicémie.

Les entérocoques sont généralement une cause rare de méningite bactérienne aiguë, représentant seulement 0, 3% à 4, 9% des cas.

Toutefois, lors de leur présentation, 10% sont produits par les espèces de faecium, 88% par les faecalis et 2% par d’autres espèces d’Enterococcus.

L'endocardite survient principalement chez les personnes âgées ou chez les patients présentant des vulvolopathies sous-jacentes qui subissent une manipulation des voies gastro-intestinales ou génito-urinaires.

Traitement

Enterococcus faecium a tendance à être plus résistant aux antimicrobiens que faecalis. La multirésistance dans ces micro-organismes représente un problème sérieux au niveau hospitalier, constituant un véritable défi pour son contrôle.

La résistance à la vancomycine est plus fréquente chez E. faecium (50%) que chez E. faecalis (5%).

Jusqu'à présent, l'un des antibiotiques sans résistance à Enterococcus faecium est le linézolide (oxazolidinone). Cet antibiotique a l'avantage de pouvoir être administré par voie orale et présente une excellente biodisponibilité.

Mais il existe également d'autres alternatives telles que les streptogramines (quinupristine / dalfopristine) uniquement pour E. faecium, car il n'est pas actif contre E. faecalis . Ainsi que les lipopeptides: (daptomycine) et glicilcycline (tigécycline).

Cependant, avant de prendre toute décision thérapeutique, il est nécessaire de disposer des résultats de laboratoire de l'antibiogramme afin de mieux utiliser les antibiotiques disponibles.

Prévention

Cette bactérie est très difficile à contrôler, mais il sera toujours utile de respecter les normes normalisées d’asepsie du personnel de santé et de procéder à la stérilisation et à l’élimination correctes du matériel contaminé.

Avantages au niveau industriel

Enterococcus faecium est utilisé pour ses effets bénéfiques chez les animaux d’élevage, en particulier chez les lapins.

Le produit de soja fermenté avec ce microorganisme entraîne une réduction de 18, 4% du cholestérol total et une augmentation de 17, 8% de la fraction HDL.

Enterococcus faecium peut également être utilisé comme probiotique, en l'intégrant dans le régime alimentaire des jeunes porcs afin de prévenir les problèmes de diarrhée après le sevrage.

On pense que E. faecium module la réponse immunitaire, ce qui permet de réduire ou de se passer d'antibiotiques.

Un autre avantage de l’incorporation d’ E. Faecium dans les régimes à faible teneur en protéines chez les porcs est la diminution de l’azote ammoniacal dans les fèces, ce qui minimise la contamination de l’environnement en réduisant l’odeur caractéristique des excréments.